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        沃特世RNA分析工具再升級,MAP Sequence 2.0助力mRNA及sgRNA序列分析

        更新時間:2026-01-12      點擊次數(shù):124


        近年來,以長鏈RNA為基礎(chǔ)的治療藥物(CRISPR sgRNA、mRNA)和疫苗發(fā)展迅速,這類RNA的核苷酸長度從100個到數(shù)千個不等,與長度相近的蛋白質(zhì)類似,僅通過完整質(zhì)量分析無法全面了解其特性。需要借助基于酶切的策略來確認(rèn)序列,并評估靶向修飾和非預(yù)期修飾。

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        全新的MAP Sequence 2.0 App能夠通過LC-MS分析寡核苷酸序列圖譜,確認(rèn)長鏈RNA分子的完整性、線性序列和修飾情況。用戶通過序列特異性RNase酶對RNA進(jìn)行酶切,生成可預(yù)測的酶切寡核苷酸產(chǎn)物后,可通過LC-MSE對這些酶切寡核苷酸進(jìn)行分析,構(gòu)建寡核苷酸圖譜。這一過程類似于酶切蛋白質(zhì)后的肽圖分析。而MAP Sequence信息學(xué)工具會利用質(zhì)量和碎片信息,將圖譜中的峰與酶切片段進(jìn)行匹配。

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        圖1. 使用MAP Sequence 2.0版比較sgRNA經(jīng)三種酶(RapiZyme Cusativin、RapiZyme MC1和RNase T1)酶解后獲得的序列覆蓋率。合并序列覆蓋率表明,通過工作流程中概述的復(fù)合酶解方法,可以實現(xiàn)沃特世sgRNA的完整序列表征。

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        MAP Sequence 2.0 App具有以下優(yōu)勢功能:

        01

        能夠原生處理來自 BioAccord、Xevo G3 QTofXevo MRT系統(tǒng)的數(shù)據(jù),可以根據(jù)自身對可用性、靈敏度和質(zhì)量準(zhǔn)確度的需求選擇合適的平臺。

        02

        具備整合多次圖譜分析結(jié)果,和靈活支持多種酶切策略的能力,為實現(xiàn)高可信度的高序列覆蓋率提供了較大可能。

        03

        提供多種用于數(shù)據(jù)審查和報告的數(shù)據(jù)及結(jié)果可視化工具,能夠清晰、簡潔地呈現(xiàn)圖譜中單個酶切寡核苷酸的結(jié)果,以及整個分子圖譜的匯總結(jié)果。

        04

        搭載在waters_connect質(zhì)譜軟件平臺,作為一款合規(guī)軟件,waters_connect可部署于產(chǎn)品及工藝研發(fā)階段的RNA表征工作,也可用于構(gòu)建經(jīng)驗證的常規(guī)分析方法,在受監(jiān)管的生產(chǎn)與產(chǎn)品放行流程中監(jiān)控這些關(guān)鍵屬性。

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